Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RNF20Q5VTR2 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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