Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ODF1Q14990 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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