Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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