Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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COL9A3Q14050 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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COL9A3Q14050 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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COL9A3Q14050 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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COL9A3Q14050 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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COL9A3Q14050 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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COL9A3Q14050 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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COL9A3Q14050 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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COL9A3Q14050 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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COL9A3Q14050 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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COL9A3Q14050 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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COL9A3Q14050 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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