Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
APOFQ13790 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
APOFQ13790 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
APOFQ13790 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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