Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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KCNMA1Q12791 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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KCNMA1Q12791 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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KCNMA1Q12791 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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KCNMA1Q12791 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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