Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPREP23469 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPREP23469 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPREP23469 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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