Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRHP20396 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRHP20396 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRHP20396 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRHP20396 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRHP20396 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRHP20396 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRHP20396 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRHP20396 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRHP20396 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRHP20396 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRHP20396 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRHP20396 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRHP20396 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRHP20396 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRHP20396 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRHP20396 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRHP20396 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRHP20396 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRHP20396 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRHP20396 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRHP20396 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRHP20396 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRHP20396 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.1 ms