Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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SH3BP1Q9Y3L3 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1Q9Y3L3 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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