Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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