Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PHF12Q96QT6 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms