Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRERF1Q96PN7 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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