Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SKIV2LQ15477 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SKIV2LQ15477 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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