Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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COL9A3Q14050 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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COL9A3Q14050 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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COL9A3Q14050 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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COL9A3Q14050 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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COL9A3Q14050 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A3Q14050 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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