Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MTMR3Q13615 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms