Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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TOP3AQ13472 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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TOP3AQ13472 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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TOP3AQ13472 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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TOP3AQ13472 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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TOP3AQ13472 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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TOP3AQ13472 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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