Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
SNTA1Q13424 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms