Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms