Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms