Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
LRRIQ1Q96JM4 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms