| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD3E-201 | ENST00000362899 | 217 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNY3P3-201 | ENST00000363816 | 102 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA80A-201 | ENST00000363922 | 136 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-7-201 | ENST00000364784 | 107 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.295-201 | ENST00000364918 | 102 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU4-66P-201 | ENST00000365199 | 138 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-8-201 | ENST00000365467 | 107 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | S100A12-201 | ENST00000368737 | 518 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PARD3-204 | ENST00000374768 | 799 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-877P-201 | ENST00000383868 | 107 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-393P-201 | ENST00000384475 | 107 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR184-201 | ENST00000384962 | 84 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR1277-201 | ENST00000408536 | 78 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-193P-201 | ENST00000410977 | 107 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL160272.1-201 | ENST00000421509 | 521 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | TRIAP1P1-201 | ENST00000427062 | 225 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP001117.1-201 | ENST00000428205 | 609 nt | TSL 2 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL669831.1-202 | ENST00000428504 | 417 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HMGB1P9-201 | ENST00000429856 | 646 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC078845.1-202 | ENST00000435996 | 733 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | GTF2IP13-201 | ENST00000438487 | 386 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC025750.2-201 | ENST00000442609 | 450 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC092802.2-202 | ENST00000444665 | 371 nt | TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPS15AP27-201 | ENST00000449183 | 343 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA59A-201 | ENST00000459326 | 152 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPS29P12-201 | ENST00000460178 | 152 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC128713.1-201 | ENST00000471495 | 306 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC02220-201 | ENST00000510065 | 270 nt | TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC114316.1-201 | ENST00000511323 | 278 nt | TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD60.2-201 | ENST00000516883 | 86 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1183P-201 | ENST00000517054 | 60 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SCARNA20.6-201 | ENST00000517251 | 106 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC104211.3-201 | ENST00000518861 | 270 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC092747.1-202 | ENST00000540595 | 380 nt | TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC096558.1-203 | ENST00000550516 | 574 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | TRAV37-201 | ENST00000553906 | 342 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC016597.1-201 | ENST00000564893 | 528 nt | TSL 4 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | FOPNL-205 | ENST00000573429 | 646 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC073539.2-201 | ENST00000597113 | 165 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC012119.1-201 | ENST00000603184 | 222 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC107294.3-201 | ENST00000609211 | 526 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC105265.4-201 | ENST00000618391 | 306 nt | TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SMAD5-AS1_1.1-201 | ENST00000619886 | 266 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC092628.2-201 | ENST00000622492 | 339 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | EFCAB5-213 | ENST00000638539 | 168 nt | TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SLC30A6-202 | ENST00000357055 | 4758 nt | TSL 2 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZMYM1-210 | ENST00000611874 | 4466 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZNF626-204 | ENST00000612591 | 4404 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP003122.5-201 | ENST00000527668 | 3766 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-534P-201 | ENST00000364877 | 106 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-166P-201 | ENST00000384371 | 107 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-434P-201 | ENST00000384376 | 107 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP354-201 | ENST00000391247 | 136 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPS4XP7-201 | ENST00000406274 | 780 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | BPY2DP-201 | ENST00000422208 | 265 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC006333.1-201 | ENST00000422401 | 410 nt | TSL 3 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | U51244.1-201 | ENST00000423120 | 374 nt | TSL 3 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC241644.2-201 | ENST00000426504 | 480 nt | TSL 3 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTND3P16-201 | ENST00000452205 | 344 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL353780.1-201 | ENST00000455583 | 458 nt | TSL 2 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01333-201 | ENST00000508083 | 724 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC079467.1-201 | ENST00000508512 | 503 nt | TSL 3 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC024022.1-202 | ENST00000508911 | 394 nt | TSL 2 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTND3P25-201 | ENST00000509243 | 135 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | IL7-206 | ENST00000520269 | 456 nt | TSL 3 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | NACAP3-201 | ENST00000552100 | 481 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL138976.2-201 | ENST00000563989 | 694 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC091043.1-201 | ENST00000579830 | 453 nt | TSL 3 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DLGAP1-AS4-201 | ENST00000582054 | 757 nt | TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR4424-201 | ENST00000585257 | 86 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP000907.4-201 | ENST00000604143 | 237 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HIF1A-201 | ENST00000323441 | 3555 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | XRCC4-203 | ENST00000396027 | 1530 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC110491.1-201 | ENST00000562191 | 2010 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPS4XP5-202 | ENST00000449995 | 1334 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RBBP8-202 | ENST00000360790 | 2962 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DPP10-205 | ENST00000410059 | 6278 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DEFB107A-201 | ENST00000335021 | 389 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU1-75P-201 | ENST00000347264 | 129 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DEFB107B-201 | ENST00000355602 | 389 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-451P-201 | ENST00000362921 | 107 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA16.2-201 | ENST00000390991 | 127 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | EI24P2-201 | ENST00000397776 | 1076 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CTNNA2-204 | ENST00000409266 | 432 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.623-201 | ENST00000411128 | 95 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP31-201 | ENST00000411144 | 127 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OFD1P1Y-201 | ENST00000411756 | 1225 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OR9R1P-201 | ENST00000412200 | 877 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | EEF1A1P41-201 | ENST00000414667 | 207 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL513365.2-201 | ENST00000423060 | 529 nt | TSL 2 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL139415.2-201 | ENST00000431968 | 163 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | USP9YP28-201 | ENST00000435142 | 589 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL135923.2-201 | ENST00000435444 | 501 nt | TSL 2 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC107083.1-201 | ENST00000439643 | 279 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01683-201 | ENST00000443479 | 412 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01162-201 | ENST00000447262 | 447 nt | TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL23AP11-201 | ENST00000475260 | 469 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HMGB1P30-201 | ENST00000492455 | 606 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PLCXD2-AS1-201 | ENST00000493131 | 491 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC026801.1-201 | ENST00000497178 | 464 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |