Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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