Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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