Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC0.5□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC0.49□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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BPTFQ12830 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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BPTFQ12830 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
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BPTFQ12830 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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