Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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KCNMA1Q12791 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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KCNMA1Q12791 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
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KCNMA1Q12791 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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KCNMA1Q12791 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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