Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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