Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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PTPRMP28827 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
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PTPRMP28827 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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PTPRMP28827 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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