Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRHP20396 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRHP20396 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRHP20396 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRHP20396 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRHP20396 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRHP20396 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRHP20396 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRHP20396 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRHP20396 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRHP20396 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRHP20396 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRHP20396 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRHP20396 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRHP20396 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRHP20396 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRHP20396 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRHP20396 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRHP20396 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRHP20396 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRHP20396 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRHP20396 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRHP20396 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRHP20396 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRHP20396 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRHP20396 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRHP20396 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRHP20396 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRHP20396 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRHP20396 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRHP20396 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRHP20396 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRHP20396 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRHP20396 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRHP20396 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRHP20396 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRHP20396 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRHP20396 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRHP20396 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRHP20396 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRHP20396 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRHP20396 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRHP20396 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRHP20396 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRHP20396 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRHP20396 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRHP20396 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRHP20396 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRHP20396 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms