Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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LRRTM2O43300 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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