Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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