Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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FOXQ1Q9C009 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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FOXQ1Q9C009 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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FOXQ1Q9C009 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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FOXQ1Q9C009 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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