Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC8.6□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
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