Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SIX1Q15475 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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SIX1Q15475 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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SIX1Q15475 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SIX1Q15475 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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SIX1Q15475 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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SIX1Q15475 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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SIX1Q15475 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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SIX1Q15475 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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SIX1Q15475 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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SIX1Q15475 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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