Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIXQ14938 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms