Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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