Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms