Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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