Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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CHAF1BQ13112 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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CHAF1BQ13112 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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CHAF1BQ13112 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1BQ13112 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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