Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXC10Q9NYD6 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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HOXC10Q9NYD6 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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HOXC10Q9NYD6 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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HOXC10Q9NYD6 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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HOXC10Q9NYD6 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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HOXC10Q9NYD6 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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HOXC10Q9NYD6 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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HOXC10Q9NYD6 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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HOXC10Q9NYD6 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXC10Q9NYD6 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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