Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHF12Q96QT6 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms