Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CSPP1Q1MSJ5 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CSPP1Q1MSJ5 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CSPP1Q1MSJ5 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CSPP1Q1MSJ5 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CSPP1Q1MSJ5 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CSPP1Q1MSJ5 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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