Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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