Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL1Q13616 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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