Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATRQ13535 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATRQ13535 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
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