Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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