Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRDM2Q13029 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRDM2Q13029 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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