Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MCCD1P59942 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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