Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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PGGT1BP53609 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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PGGT1BP53609 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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PGGT1BP53609 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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PGGT1BP53609 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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PGGT1BP53609 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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