Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHF12Q96QT6 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms