Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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RTN1Q16799 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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RTN1Q16799 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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RTN1Q16799 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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RTN1Q16799 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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RTN1Q16799 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
RTN1Q16799 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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