Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC0.63□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.6□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EEA1Q15075 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
EEA1Q15075 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms